RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.92□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A10PA6NDY2 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.92□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 CDIPTO14735 213 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.92□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 C11orf94C9JXX5 98 aa11.91□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.91□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 MSL2Q9HCI7 577 aa11.91□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 EDDM3BP56851 147 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 Q6P435 159 aa11.91□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 CELA3BP08861 270 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 OR3A1P47881 315 aa11.9□□□□□ -0.5
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PRAME-214ENST00000543184 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 K7EM74 188 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 WNT9BO14905 357 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-214ENST00000543184 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 TGOLN2O43493 480 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 GFRA1P56159 465 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 BATFQ16520 125 aa11.9□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.9□□□□□ -0.51
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PRAME-214ENST00000543184 PSPNO60542 156 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 MAGEA5P43359 124 aa11.89□□□□□ -0.51
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PRAME-214ENST00000543184 GCGP01275 180 aa11.89□□□□□ -0.51
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PRAME-214ENST00000543184 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 AGMATQ9BSE5 352 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 SPINK4O60575 86 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 SLC25A6P12236 298 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 CYB561P49447 251 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 ZNF573Q86YE8 665 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-214ENST00000543184 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.88□□□□□ -0.51
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