RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 EMP1P54849 157 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 DHRS2Q13268 280 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 GGNQ86UU5 652 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0A6YYJ9 748 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GUS0 222 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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POLR1B-217ENST00000541869 OR2C3Q8N628 320 aa8.71□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.71□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.71□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ZP1P60852 638 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.71□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 H0Y980 276 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 IRF3Q14653 427 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 UBE2V2Q15819 145 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.71□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 FBXL15Q9H469 300 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV1-46P01743 117 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF735P0CB33 412 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PSG2P11465 335 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TDGF1P13385 188 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 BAP18Q8IXM2 172 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 FCER1GP30273 86 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 BIVMQ86UB2 503 aa8.7□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 IGKV3-15P01624 115 aa8.7□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 ZNF90Q03938 601 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 BAK1Q16611 211 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.7□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C18orf12Q96KH6 178 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PSPNO60542 156 aa8.7□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 U3KQ87 197 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 NBR2O15453 112 aa8.69□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 DLX6P56179 175 aa8.69□□□□□ -1.02
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POLR1B-217ENST00000541869 NPFFO15130 113 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV3-20P01619 116 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SCTP09683 121 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TEPPQ6URK8 271 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 V9GYS6 101 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 EREGO14944 169 aa8.69□□□□□ -1.02
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