RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAPL1A0PJW8 107 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC16A6O15403 523 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CA11O75493 328 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM107AO95990 144 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAP2AP10114 183 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEACAM6P40199 344 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGN3Q15651 99 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS8Q16651 343 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHFR2Q86XF0 187 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORAI1Q96D31 301 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4orf36Q96KX1 117 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JAM3Q9BX67 310 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF221Q9UK13 617 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPPA5A6NC42 116 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf61A6NNL5 157 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F8W735 103 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SC5DO75845 299 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTL6BO94805 426 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTT2P0CG29 244 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTT2BP0CG30 244 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIFP14174 115 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYOD1P15172 320 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FUT3P21217 361 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR183P32249 361 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LEMD1Q68G75 181 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF529Q6P280 563 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPIN2AQ99865 258 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC42Q9Y546 428 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAPP51397 102 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MNAT1P51948 309 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP3R1P63098 170 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF212Q495C1 297 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLET1Q6UQ28 207 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF503Q96F45 646 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR14A2Q96R54 314 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 X6R8D5 127 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B2RBV5 119 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E9PI62 339 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTN3P15516 51 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALP22466 123 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPY1RP25929 384 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BDKRB2P30411 391 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XGP55808 180 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A2Q01362 244 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBX3Q13185 183 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR176Q14439 515 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C12orf73Q69YU5 71 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSX9Q7RTT3 188 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT8Q8NBV8 401 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUL1Q969V5 352 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NICN1Q9BSH3 213 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THTPAQ9BU02 230 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NACAE9PAV3 2078 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM212A6NML5 194 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZAR1LA6NP61 321 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REG1AP05451 166 aa7.27□□□□□ -1.25
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