RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 H7C2Y5 167 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 NDUFB3O43676 98 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RAMP3O60896 148 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 KRASP01116 189 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 APOC3P02656 99 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 PRH1P02810 166 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CD80P33681 288 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 PPT1P50897 306 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ZNF273Q14593 569 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 GUK1Q16774 197 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RTL8BQ17RB0 113 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 KHDC3LQ587J8 217 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 DTD1Q8TEA8 209 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RAB1CQ92928 201 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ZNF714Q96N38 554 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 P2RX4Q99571 388 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 HRH4Q9H3N8 390 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RBKSQ9H477 322 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RAXQ9Y2V3 346 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 C15orf61A6NNL5 157 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 F8W036 122 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 M0R1X1 148 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CCL21O00585 134 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CST7O76096 145 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 EPHA1P21709 976 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 IL3RAP26951 378 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 MC5RP33032 325 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 G6PCP35575 357 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ZNF134P52741 427 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 OR2B8PP59922 312 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 DLK1P80370 383 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RELBQ01201 579 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CLINT1Q14677 625 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 HFEQ30201 348 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TMEM177Q53S58 311 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 SPRNQ5BIV9 151 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 PDPNQ86YL7 162 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 OR5B3Q8NH48 314 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 OR4A16Q8NH70 328 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RFESDQ8TAC1 157 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 GPHA2Q96T91 129 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RNF5Q99942 180 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TREM1Q9NP99 234 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PPE2 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PR64 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PRV1 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 TMPRSS2O15393 492 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 FCGR3BO75015 233 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 APOA2P02652 100 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 GYPAP02724 150 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ADCYAP1P18509 176 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RAB13P51153 203 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 DLX6P56179 175 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 RAB11AP62491 216 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 CCL8P80075 99 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 ZNF616Q08AN1 781 aa6.19□□□□□ -1.42
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