RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 CA11O75493 328 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RP2O75695 350 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DHRS3O75911 302 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 VAMP5O95183 116 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RLN1P04808 185 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CRYBA1P05813 215 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HPNP05981 417 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 QDPRP09417 244 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SPP1P10451 314 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 COX5BP10606 129 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CBR1P16152 277 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF43P17038 809 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SRD5A2P31213 254 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 S100A11P31949 105 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PTGFRP43088 359 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR3A4PP47883 348 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HTR5AP47898 357 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CSNK1A1P48729 337 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RBP2P50120 134 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CLDN17P56750 224 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TAS2R31P59538 309 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PPP1R1AQ13522 171 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RAB35Q15286 201 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HYAL4Q2M3T9 481 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 AARDQ4LEZ3 155 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ACTBL2Q562R1 376 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RAET1LQ5VY80 246 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMUB2Q71RG4 321 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SSX9Q7RTT3 188 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM104Q8NE00 496 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR1S1Q8NH92 325 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MITD1Q8WV92 249 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM230Q96A57 120 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 FGGYQ96C11 551 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 C10orf35Q96D05 121 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CMBLQ96DG6 245 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PFDN5Q99471 154 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CHIAQ9BZP6 476 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CHST6Q9GZX3 395 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 METTL9Q9H1A3 318 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TUBA4BQ9H853 241 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CENPMQ9NSP4 180 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DKKL1Q9UK85 242 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DYSFO75923 2080 aa3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TGP01266 2768 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CUBNO60494 3623 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZANQ9Y493 2812 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 A0A0B4J2A0 478 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 A0A0J9YW62 118 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 A0A1W2PPQ1 181 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR6C6A6NF89 314 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 GJE1A6NN92 205 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 COLCA2A8K830 154 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 M0R135 149 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 LGALS8O00214 317 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TCAPO15273 167 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RAD51DO75771 328 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SIX6O95475 246 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 F10P00742 488 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 IGHV2-5P01817 119 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CST2P09228 141 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SLC25A4P12235 298 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 AADACP22760 399 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CD34P28906 385 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 AGTR1P30556 359 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HRH1P35367 487 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 KCNJ3P48549 501 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ASCL1P50553 236 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms