RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 CEACAM6P40199 344 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 SERPINB10P48595 397 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 SPHARQ15513 63 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 MED22Q15528 200 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 TRAM1Q15629 374 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 CENPOQ9BU64 300 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 HSF4Q9ULV5 492 aa8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 CD37P11049 281 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 AADACP22760 399 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 LGALS7P47929 136 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 PSMD7P51665 324 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 AQP4P55087 323 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 UNC119Q13432 240 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 INSL4Q14641 139 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 IRF3Q14653 427 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 FXYD3Q14802 87 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 PSG5Q15238 335 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 POC5Q8NA72 575 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 PTX4Q96A99 478 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 AGMATQ9BSE5 352 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 NICN1Q9BSH3 213 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 DUSP21Q9H596 190 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 AK3Q9UIJ7 227 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.34□□□□□ -1.07
RNF4-218ENST00000513284 SLC17A2O00624 439 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 OR2A4O95047 310 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 UCHL1P09936 223 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 KIR2DS2P43631 304 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RAB11BQ15907 218 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 Q9N2K0 584 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TRDCB7Z8K6 153 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 M0R1X1 148 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 SOCS1O15524 211 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 SCTP09683 121 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CD3GP09693 182 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RRASP10301 218 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 LINC00205P59089 165 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 QRFPP83859 136 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TPBGQ13641 420 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 GUCA2BQ16661 112 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RTL8BQ17RB0 113 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 USMG5Q96IX5 58 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 HARBI1Q96MB7 349 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RDH8Q9NYR8 311 aa8.32□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 A0A0B4J203 849 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 BMPR1BO00238 502 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 SHOXO15266 292 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 SPRY2O43597 315 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 PROP1O75360 226 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 NDUFB8O95169 186 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 DIRAS3O95661 229 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 GADD45AP24522 165 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 P2RY14Q15391 338 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RPEL1Q2QD12 228 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 ZNF383Q8NA42 475 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 BVESQ8NE79 360 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 PHB2Q99623 299 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 PECRQ9BY49 303 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 PEMTQ9UBM1 199 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.31□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 A0A0A6YYD4 124 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 PDCD5O14737 125 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 MPPED1O15442 326 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms