RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489994.5

IFRD1-215, Transcript of interferon related developmental regulator 1, human

TSL 1 (best)

Gene IFRD1, Length 1,721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFRD1-215	ENST00000489994	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ODAM	A1E959	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	C7orf71	A4D174	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZIC3	O60481	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	DHRS3	O75911	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	OR2H2	O95918	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	CTSE	P14091	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	CD99	P14209	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	MAGEA5	P43359	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	REG1B	P48304	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	SELENOP	P49908	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	TPPP2	P59282	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	FRZB	Q92765	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	GABRG3	Q99928	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994		F5H5P2	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	CHEK1	O14757	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	BCL2L11	O43521	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	CD5L	O43866	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	TBL1X	O60907	577 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	BCKDHA	P12694	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	DIO3	P55073	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	LCN6	P62502	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PSG9	Q00887	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	POLQ	O75417	2590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994		A6NDN8	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-215	ENST00000489994		H0YJW9	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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