RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 R3HDM4Q96D70 268 aa13.02□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIEZO1Q92508 2521 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 J3QT63 122 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFNA5P01569 189 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6P435 159 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAXO1Q8IYX7 474 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMMD1Q8N668 190 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB39BQ96DA2 213 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRASP01116 189 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL16Q0P5N6 197 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5R1Q8NH85 324 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YPEL4Q96NS1 127 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSENENQ9NZ42 101 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.01□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5B21A6NL26 309 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPRY3O43610 288 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM11P17152 192 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB11AP62491 216 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF151Q2KHN1 245 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP5SQ99766 215 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WSB1Q9Y6I7 421 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGKV3-15P01624 115 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFPI2P48307 235 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTP5Q14D33 572 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TESK1Q15569 626 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF429Q86V71 674 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1L1Q8NH94 360 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLK3Q9H4B4 646 aa13□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS47A8MTI9 375 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEACAM4O75871 244 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CGAP01215 116 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL24Q13007 206 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf53Q8IXP5 236 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LFNGQ8NES3 379 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRGPRDQ8TDS7 321 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGKV1-5P01602 117 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMBPP02760 352 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR3A1P47881 315 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5I1Q13606 314 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX38Q6PEX7 206 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZS92 163 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIAH2O43255 324 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYNGR2O43760 224 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EGR1P18146 543 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COX5AP20674 150 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABRA2P47869 451 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLK1P80370 383 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZS49 121 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPRMQ9NS64 109 aa12.99□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAMP3O60896 148 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN1O95832 211 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV2-14P01704 120 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCH1P30793 250 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSTR5P35346 364 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ICAM4Q14773 271 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTF1Q5T230 341 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52L2PQ8NGH6 319 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAND1O96004 215 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRP19P09132 144 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAC2P15153 192 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLIPR1P48060 266 aa12.98□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRP5LA4QPB2 252 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD55P08174 381 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 G6PCP35575 357 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R30P59541 319 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLE4Q04727 773 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPACA3Q8IXA5 215 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRAM1Q8N682 238 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2D2Q9H210 308 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AHRRA9YTQ3 701 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD81P60033 236 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAX5Q02548 391 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC2AQ6UVW9 174 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSX7Q7RTT5 188 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGFRL1Q8N441 504 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR8G5Q8NG78 346 aa12.97□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF585BQ52M93 769 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR82Q6UXN9 313 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms