RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 RLN3Q8WXF3 142 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 C16orf92Q96LL3 132 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 PRRT4C9JH25 899 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 NABP2Q9BQ15 211 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.5□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CACNA1SQ13698 1873 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 METTL12A8MUP2 240 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 GAGE1Q13065 139 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 AGMATQ9BSE5 352 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 WDR54Q9H977 334 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 PEX7O00628 323 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 SYNGR3O43761 229 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HBDP02042 147 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 SOSTQ9BQB4 213 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM160Q9NX00 188 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF83P51522 516 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 FXYD3Q14802 87 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 C14orf144Q96I85 54 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 GDF15Q99988 308 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 PRSS2P07478 247 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CT62P0C5K7 136 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ICAM4Q14773 271 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM186Q96B77 213 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 RAX2Q96IS3 184 aa6.49□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 NUP98P52948 1817 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BKO60814 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BJP06899 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BOP23527 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 COX7A1P24310 79 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BBP33778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ADMP35318 185 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BDP58876 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BCP62807 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CCL20P78556 96 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 FUT5Q11128 374 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF479Q96JC4 524 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 FOXC2Q99958 501 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 OTORQ9NRC9 128 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 GLI3P10071 1580 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 SERF1AO75920 110 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 C1QL1O75973 258 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CXCL10P02778 98 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CD3EP07766 207 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 PTGDSP41222 190 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 GFERP55789 205 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 DRAM1Q8N682 238 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 FOXQ1Q9C009 403 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 NHSQ6T4R5 1651 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 RNF222A6NCQ9 220 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 CD5P06127 495 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 MGAT2Q10469 447 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 ATOH7Q8N100 152 aa6.48□□□□□ -1.37
MEIS1-209ENST00000488550 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms