RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482563.1

RBM39-233, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 1,737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-233	ENST00000482563	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CD28	P10747	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PSMD8	P48556	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	MMD	Q15546	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		A0A0J9YY10	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		A0A1B0GX78	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SLC17A3	O00476	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CKS1B	P61024	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GNB2	P62879	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RHEB	Q15382	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RGS5	O15539	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CGB3	P0DN86	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CGB7	P0DN87	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	FRZB	Q92765	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	LRP4	O75096	1905 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		A0A1B0GV90	55 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		E7EQ34	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PIR	O00625	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SCO1	O75880	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	OR2J2	O76002	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	NDUFC2	O95298	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GYPC	P04921	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	NRTN	Q99748	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		A6NDX4	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	FGF12	P61328	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		Q8N9W7	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GPR84	Q9NQS5	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SOGA1	O94964	1423 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		A8MWL6	223 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	OPRM1	P35372	400 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GNA12	Q03113	381 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CEP170	Q5SW79	1584 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		Q6ZS49	121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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