RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478216.1

RC3H2-208, Transcript of ring finger and CCCH-type domains 2, human

TSL 3

Gene RC3H2, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RC3H2-208	ENST00000478216	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RC3H2-208	ENST00000478216	PTX4	Q96A99	478 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM80	Q96HE8	168 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RC3H2-208	ENST00000478216	SPRY2	O43597	315 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	OR2C1	O95371	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CRYGB	P07316	175 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CEL	P19835	753 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	BMI1	P35226	326 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TTC23	Q5W5X9	447 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	NECAP1	Q8NC96	275 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	MYL12B	O14950	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	BET1	O15155	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ATP5H	O75947	161 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CRYZL1	O95825	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	RRAS	P10301	218 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CBLN1	P23435	193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ARL3	P36405	182 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ZNF45	Q02386	682 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	UNC119	Q13432	240 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	PRSS8	Q16651	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TM4SF20	Q53R12	229 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216		Q9N2K0	584 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	HERC2	O95714	4834 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	LGALS9	O00182	355 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SOCS1	O15524	211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SRM	P19623	302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SERPINB10	P48595	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	UBE2K	P61086	200 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TPBG	Q13641	420 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	MLX	Q9UH92	298 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216		A0A0A6YYD4	124 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	BPNT1	O95861	308 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216		Q6ZWC4	215 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216		S4R3C0	116 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CD3G	P09693	182 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	GSTT2	P0CG29	244 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	GSTT2B	P0CG30	244 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ST3GAL4	Q11206	333 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	INSL4	Q14641	139 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	P2RY14	Q15391	338 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	MED22	Q15528	200 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	STPG3	Q8N7X2	389 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	UBE2C	O00762	179 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RC3H2-208	ENST00000478216	FABP7	O15540	132 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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