RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A17O43808 307 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 PPYP01298 95 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 IGLV1-40P01703 118 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 NAT1P18440 290 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 BVESQ8NE79 360 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-211ENST00000476336 LINC00473A8K010 186 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 FAM25AB3EWG3 89 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 FAM25CB3EWG5 89 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 FAM25GB3EWG6 89 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CNIH1O95406 144 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 UBE2KP61086 200 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 HERV-K104P61576 105 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CATR1Q13166 79 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 DYRK1AQ13627 763 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 REC114Q7Z4M0 266 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 OR5H2Q8NGV7 314 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 OR4S2Q8NH73 311 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CD300LFQ8TDQ1 290 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 GPX8Q8TED1 209 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 ARPC1AQ92747 370 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 SNAPC3Q92966 411 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 WSB1Q9Y6I7 421 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 H3BUA1 57 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 FCN1O00602 326 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 HPGDSO60760 199 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CRYZL1O95825 349 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CA2P00918 260 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 HRASP01112 189 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 IGLV2-23P01705 113 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CRYGBP07316 175 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 ELK1P19419 428 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 S100GP29377 79 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 RAB9AP51151 201 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 LINC00205P59089 165 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 RUNX1Q01196 453 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 FXYD3Q14802 87 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 ACTBL2Q562R1 376 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 MFSD4AQ8N468 514 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 SLC5A7Q9GZV3 580 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 EHFQ9NZC4 300 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 SCOCQ9UIL1 159 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 VSIG4Q9Y279 399 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 G3V318 75 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 J3QRK9 145 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 FCGR3BO75015 233 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 ACTL6BO94805 426 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 BRI3O95415 125 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 IGLV2-14P01704 120 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 PTHLHP12272 177 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 AADACP22760 399 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 RCVRNP35243 200 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 ECSCRQ19T08 205 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 MMD2Q8IY49 270 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 POC5Q8NA72 575 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 C5orf30Q96GV9 206 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CLCC1Q96S66 551 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 P2RX4Q99571 388 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PN81 502 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CCL24O00175 119 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 RGS5O15539 181 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 TBPP20226 339 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 CHRNA7P36544 502 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-211ENST00000476336 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms