RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472645.1

TIMM17B-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, human

TSL 3

Gene TIMM17B, Length 804 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM17B-206	ENST00000472645	NEK7	Q8TDX7	302 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	HYLS1	Q96M11	299 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	GPR132	Q9UNW8	380 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TRDC	B7Z8K6	153 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	RGS11	O94810	467 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	DUSP1	P28562	367 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	CD34	P28906	385 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	P2RX3	P56373	397 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	DHODH	Q02127	395 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645		Q6P435	159 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	CORO2A	Q92828	525 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	RCHY1	Q96PM5	261 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645		Q9N2K0	584 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	MGST3	O14880	152 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	CSN2	P05814	226 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	HLA-G	P17693	338 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR3A1	P47881	315 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	RAP2B	P61225	183 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	FCN2	Q15485	313 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	DEFB136	Q30KP8	78 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	LIN54	Q6MZP7	749 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	LYG2	Q86SG7	212 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	COMMD1	Q8N668	190 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	PHB2	Q99623	299 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	RAB9B	Q9NP90	201 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OOSP1	A8MZH6	123 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TOR1A	O14656	332 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR2H2	O95918	312 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	IGHG2	P01859	326 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	CEACAM3	P40198	252 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	VSIG4	Q9Y279	399 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645		A0A087X0M5	115 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645		A0A1B0GX30	115 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	FABP7	O15540	132 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	B3GALNT1	O75752	331 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR2A4	O95047	310 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	C4BPB	P20851	252 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZBTB25	P24278	435 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	PRRX1	P54821	245 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLC35B1	P78383	322 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	DHRS2	Q13268	280 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	STPG2	Q8N412	459 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	OR2A7	Q96R45	310 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TIMM17B-206	ENST00000472645	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TIMM17B-206	ENST00000472645	S100G	P29377	79 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TIMM17B-206	ENST00000472645	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TIMM17B-206	ENST00000472645	GLIPR1	P48060	266 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TIMM17B-206	ENST00000472645	HERV-K104	P61576	105 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TIMM17B-206	ENST00000472645	HLA-DRB3	P79483	266 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TIMM17B-206	ENST00000472645	FGL1	Q08830	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TIMM17B-206	ENST00000472645	HNF4G	Q14541	408 aa		12.45	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms