RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 HARBI1Q96MB7 349 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 KLK15Q9H2R5 256 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IFT46Q9NQC8 304 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.15□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PN81 502 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FAM25AB3EWG3 89 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FAM25CB3EWG5 89 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FAM25GB3EWG6 89 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CCL24O00175 119 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SOX15O60248 233 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FCGR3BO75015 233 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CRYZL1O95825 349 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PPYP01298 95 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 NAT1P18440 290 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CHRNA7P36544 502 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FXYD3Q14802 87 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CDK10Q15131 360 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 KCTD9Q7L273 389 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MFSD4AQ8N468 514 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TEX45Q8NA69 505 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 LFNGQ8NES3 379 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 GPX8Q8TED1 209 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 AP3S1Q92572 193 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RAX2Q96IS3 184 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DUX3Q96PT4 197 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 P2RX4Q99571 388 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.14□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TNFSF12O43508 249 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CNIH1O95406 144 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PMP2P02689 132 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RFX2P48378 723 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FXYD4P59646 89 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 UBE2KP61086 200 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 GNB1P62873 340 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DYRK1AQ13627 763 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SPCS2Q15005 226 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MSMO1Q15800 293 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DEFB136Q30KP8 78 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ACTBL2Q562R1 376 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 ARPC1AQ92747 370 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 GPHA2Q96T91 129 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 EHFQ9NZC4 300 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 VSIG4Q9Y279 399 aa7.13□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DMAP28067 261 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 CD40LGP29965 261 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 TMBIM6P55061 237 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR5T1Q8NG75 326 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR11H1Q8NG94 326 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 MS4A10Q96PG2 267 aa7.12□□□□□ -1.27
SYN3-211ENST00000472027 OR5B12Q96R08 314 aa7.12□□□□□ -1.27
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