RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 HLA-DMAP28067 261 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC6A1P30531 599 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 GNRHRP30968 328 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 KIR2DS2P43631 304 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RFX2P48378 723 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 UCP3P55916 312 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBE2KP61086 200 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 HERV-K104P61576 105 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 DGCR2P98153 550 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXE3Q13461 319 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4S2Q8NH73 311 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM63Q969Q1 353 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 GON7Q9BXV9 100 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 MMP27Q9H306 513 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBXL15Q9H469 300 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLK11Q9UBX7 282 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 V9GYH0 126 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC01548A6NM66 108 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A17O43808 307 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PEX14O75381 377 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CRYZL1O95825 349 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSPAN15O95858 294 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV1-40P01703 118 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PMP2P02689 132 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PSMB8P28062 276 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TNFSF8P32971 234 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ETV6P41212 452 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC35B1P78383 322 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CX3CL1P78423 397 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CATR1Q13166 79 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 POU2AF1Q16633 256 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 LIN54Q6MZP7 749 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC190Q86UF4 302 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM17Q86X19 198 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CADM3Q8N126 398 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TEX45Q8NA69 505 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 COMMD9Q9P000 198 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 DPPA5A6NC42 116 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC160A6NGH7 325 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR31O00270 319 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SHOXO15266 292 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 BRI3O95415 125 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CA2P00918 260 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD3DP04234 171 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FCER2P06734 321 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ELANEP08246 267 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CSF1P09603 554 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 VDAC1P21796 283 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAS2R19P59542 299 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FXYD4P59646 89 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RND3P61587 244 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 IL18Q14116 193 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 MEF2DQ14814 521 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF79Q15937 498 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRSS8Q16651 343 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TEX38Q6PEX7 206 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TREML4Q6UXN2 200 aa6.5□□□□□ -1.37
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