RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	NQO2	P16083	231 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	PDLIM4	P50479	330 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF137P	P52743	207 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	MED6	O75586	246 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM50A	O95807	157 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	IAPP	P10997	89 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	COX7A1	P24310	79 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	REG1B	P48304	166 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PAX9	P55771	341 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	DLX1	P56177	255 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2B8P	P59922	312 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB14	P61106	215 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CLLU1	Q5K131	121 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RBKS	Q9H477	322 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435		H3BP45	60 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435		M0R1W7	72 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	HRAS	P01112	189 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RRAS	P10301	218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PRRX1	P54821	245 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	NHLH2	Q02577	135 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BAX	Q07812	192 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		10.01	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435		A8MXK9	166 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435		H0YJW9	148 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435		H7C2Y5	167 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV1-47	P01700	117 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R30	P59541	319 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE2K	P61086	200 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ARF6	P62330	175 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	POU2AF1	Q16633	256 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	STX12	Q86Y82	276 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PDPN	Q86YL7	162 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PNKD	Q8N490	385 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435		Q8N7P7	452 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4A16	Q8NH70	328 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	GSX2	Q9BZM3	304 aa		10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	SHOX	O15266	292 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	TXNL1	O43396	289 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	JTB	O76095	146 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	CST7	O76096	145 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV1-16	P04430	117 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP5J2	P56134	94 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	RELB	Q01201	579 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDLBP-231	ENST00000467435	AARD	Q4LEZ3	155 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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