RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-204ENST00000443667 CELA1Q9UNI1 258 aa6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 J3QLW9 94 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 TSPAN4O14817 238 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SC5DO75845 299 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 APOA2P02652 100 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CD74P04233 296 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 RAP2AP10114 183 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 GTF2F2P13984 249 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF19P17023 458 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MAP2K4P45985 399 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CCR9P51686 369 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 HMGN3Q15651 99 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 FAM209BQ5JX69 171 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 DDI2Q5TDH0 399 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 Q5VSD8 79 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF529Q6P280 563 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SETD9Q8NE22 299 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ORAI1Q96D31 301 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 HARBI1Q96MB7 349 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 AGMATQ9BSE5 352 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 BANF2Q9H503 90 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 OR4C46A6NHA9 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 HMX3A6NHT5 357 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SLC16A6O15403 523 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 GPX5O75715 221 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 RPA2P15927 270 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 TFPI2P48307 235 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MS4A2Q01362 244 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C12orf74Q32Q52 190 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C12orf73Q69YU5 71 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 DHFR2Q86XF0 187 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MARC2Q969Z3 335 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C4orf36Q96KX1 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 DAPL1A0PJW8 107 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 E9PI62 339 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 M0R1X1 148 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 PRDX6P30041 224 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 DAPP51397 102 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 KRTAP10-2P60368 255 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 PRSS8Q16651 343 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 OR14A2Q96R54 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.3□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZAR1LA6NP61 321 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CA11O75493 328 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 FUT3P21217 361 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CEACAM6P40199 344 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 SETD6Q8TBK2 473 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MUL1Q969V5 352 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ASB9Q96DX5 294 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 JAM3Q9BX67 310 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MDFICQ9P1T7 246 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.29□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 FAM107AO95990 144 aa6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 CLEC3BP05452 202 aa6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 BDKRB2P30411 391 aa6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 GPR183P32249 361 aa6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MNAT1P51948 309 aa6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 MLANAQ16655 118 aa6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.28□□□□□ -1.4
PDZK1-204ENST00000443667 C6orf223Q8N319 242 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms