RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM100Q9NV29 134 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IL19Q9UHD0 177 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 I3L521 148 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 BMPR1BO00238 502 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 GOSR2O14653 212 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ARPC5O15511 151 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SSX5O60225 188 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TSC22D2O75157 780 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS3O75911 302 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SFT2D2O95562 160 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CST2P09228 141 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PTHLHP12272 177 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MSR1P21757 451 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PRKACBP22694 351 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PTGFRP43088 359 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM50BP56557 158 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MELKQ14680 651 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM42Q69YG0 159 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CORO6Q6QEF8 472 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZS49 121 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SKA3Q8IX90 412 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR51A2Q8NGJ7 313 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR4K15Q8NH41 348 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 THAP6Q8TBB0 222 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A40Q8TBP6 338 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ST8SIA4Q92187 359 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SPTSSAQ969W0 71 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SPSB1Q96BD6 273 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RAB3CQ96E17 227 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CHST5Q9GZS9 411 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ARL6Q9H0F7 186 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SIRPDQ9H106 197 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CENPMQ9NSP4 180 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 IL36GQ9NZH8 169 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 VSIG4Q9Y279 399 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM235A6NFC5 223 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 SYNGR1O43759 233 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PET100P0DJ07 73 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 DTYMKP23919 212 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MPV17P39210 176 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PRKXP51817 358 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PCBD1P61457 104 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 FMODQ06828 376 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TAF13Q15543 124 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM123Q8N131 208 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 LRTM2Q8N967 370 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 PXT1Q8NFP0 134 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR5AP2Q8NGF4 316 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 OR8B12Q8NGG6 310 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms