RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79	6e-7	■■□□□ 11.8
PTPRF-205	ENST00000414879	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	EFNA2	O43921	213 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SPINK2	P20155	84 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	METTL26	Q96S19	204 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879		A0A1W2PPE3	182 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	G0S2	P27469	103 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	BCL2	P10415	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	NAT1	P18440	290 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ARF6	P62330	175 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879		Q0VFX4	171 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	HIST3H3	Q16695	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM168A	Q92567	244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879		P01737	135 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PPOX	P50336	477 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	APC2	O95996	2303 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	DEFA6	Q01524	100 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879		M0QZK8	103 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	HKR1	P10072	659 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OR10J1	P30954	320 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SCN2A	Q99250	2005 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC25A17	O43808	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	LOXL3	P58215	753 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PSG9	Q00887	426 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PNKD	Q8N490	385 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SOST	Q9BQB4	213 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	PAGE4	O60829	102 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	S1PR2	O95136	353 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	LINC00869	P0C866	280 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	COL8A1	P27658	744 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	NHLH2	Q02577	135 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRF-205	ENST00000414879	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms