RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 PSG7Q13046 419 aa20.53■□□□□ 0.88
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FAAP20-206ENST00000414253 ZNF645Q8N7E2 425 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-206ENST00000414253 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-206ENST00000414253 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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FAAP20-206ENST00000414253 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-206ENST00000414253 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB34Q8NCN2 500 aa20.52■□□□□ 0.88
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FAAP20-206ENST00000414253 MISP3Q96FF7 219 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-206ENST00000414253 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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FAAP20-206ENST00000414253 CLN8Q9UBY8 286 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-206ENST00000414253 FUT9Q9Y231 359 aa20.52■□□□□ 0.88
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FAAP20-206ENST00000414253 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 ST8SIA5O15466 376 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 PAGE4O60829 102 aa20.51■□□□□ 0.87
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FAAP20-206ENST00000414253 TMEM18Q96B42 140 aa20.5■□□□□ 0.87
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FAAP20-206ENST00000414253 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.5■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 PRR14LQ5THK1 2151 aa20.5■□□□□ 0.87
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FAAP20-206ENST00000414253 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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FAAP20-206ENST00000414253 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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FAAP20-206ENST00000414253 ZNF146Q15072 292 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 SELLP14151 372 aa20.49■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 RPL30P62888 115 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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FAAP20-206ENST00000414253 NXPH2O95156 264 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 SELEP16581 610 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 HOXC12P31275 282 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 VWC2Q2TAL6 325 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.48■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 GRPP07492 148 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 FOSL1P15407 271 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 SSX2Q16385 188 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 C5orf30Q96GV9 206 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 KCNIP1Q9NZI2 227 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 CEACAM4O75871 244 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 S1PR2O95136 353 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 CCKARP32238 428 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 LCN2P80188 198 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 CATR1Q13166 79 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 TAAR6Q96RI8 345 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 DOCK11Q5JSL3 2073 aa20.47■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 C11orf94C9JXX5 98 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 MLNRO43193 412 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 NPPCP23582 126 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 OR1L1Q8NH94 360 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 ZDHHC16Q969W1 377 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 USF3Q68DE3 2245 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM210A6NLX4 147 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 C17orf112F2Z3M2 114 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 MGAQ8IWI9 3026 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 GALMQ96C23 342 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 OBP2BQ9NPH6 170 aa20.46■□□□□ 0.87
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-206ENST00000414253 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-206ENST00000414253 OR3A1P47881 315 aa20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-206ENST00000414253 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FAAP20-206ENST00000414253 CNN1P51911 297 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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