RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 C5orf30Q96GV9 206 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RITA1Q96K30 269 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OR4C12Q96R67 309 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 MC5RP33032 325 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 NCS1P62166 190 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 RNF5Q99942 180 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 RNF150Q9ULK6 438 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 A0A087WW49 117 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 TALDO1P37837 337 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 CNIH2Q6PI25 160 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 RRHO14718 337 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 SOX15O60248 233 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 GNG2P59768 71 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 CX3CL1P78423 397 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 DIABLOQ9NR28 239 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 LINC00205P59089 165 aa9.49□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.49□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.49□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 H7C2Y5 167 aa9.48□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 BEST4Q8NFU0 473 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 MS4A10Q96PG2 267 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 GINS4Q9BRT9 223 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 A8MZ25 164 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 M0R1X1 148 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 IGLV1-51P01701 117 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 IGLV2-23P01705 113 aa9.47□□□□□ -0.89
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