RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 DERL3Q96Q80 235 aa10□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 UQCC2Q9BRT2 126 aa10□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 OR2J3O76001 311 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 UNC119Q13432 240 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 PRSS8Q16651 343 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 C15orf32Q32M92 178 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM177Q53S58 311 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 CBR4Q8N4T8 237 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 THRSPQ92748 146 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 SLC29A1Q99808 456 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 TM2D1Q9BX74 207 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 RDH8Q9NYR8 311 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 GHRLQ9UBU3 117 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 AK3Q9UIJ7 227 aa9.99□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 A0A1B0GVY2 172 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 SHOXO15266 292 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 MPPED1O15442 326 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 IGHV3-23P01764 117 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 DCKP27707 260 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 BTNL8Q6UX41 500 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 GPHB5Q86YW7 130 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 NECAP1Q8NC96 275 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 RNF183Q96D59 192 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 CCDC140Q96MF4 163 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 Q9N2K0 584 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 S4R3C0 116 aa9.98□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 A8MWP6 167 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 CD3GP09693 182 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 CTRB1P17538 263 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 APOC4P55056 127 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 UBE2KP61086 200 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 QRFPP83859 136 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 INSL4Q14641 139 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 TEX45Q8NA69 505 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF320A2RRD8 509 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 SOCS1O15524 211 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 UBBP0CG47 229 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 MED14OSP0DP75 135 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 GGHQ92820 318 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 OR2D2Q9H210 308 aa9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 HMX3A6NHT5 357 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 UBE2CO00762 179 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 S1PR2O95136 353 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 ARL3P36405 182 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.95□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 TEX22C9J3V5 150 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 CRYZL1O95825 349 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 C8orf88P0DMB2 117 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 MYL12AP19105 171 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 SRMP19623 302 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM50BP56557 158 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 RTL8BQ17RB0 113 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM209BQ5JX69 171 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 SPIN2AQ99865 258 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.94□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 PKD1P98161 4303 aa9.93□□□□□ -0.82
CHCHD2-201ENST00000395422 HSPG2P98160 4391 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms