RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 GOSR1O95249 250 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IGFBP2P18065 325 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR10J1P30954 320 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CDKN1BP46527 198 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ADIPOQQ15848 244 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RNF144BQ7Z419 303 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IL36GQ9NZH8 169 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 NAGKQ9UJ70 344 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GAB2Q9UQC2 676 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 E7EQL1 145 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MPIG6BO95866 241 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CD55P08174 381 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZNF266Q14584 549 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR51I2Q9H344 312 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 B9A039 149 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IFNL4K9M1U5 179 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MLNRO43193 412 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TNFSF4P23510 183 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RAB11AP62491 216 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ARFRP1Q13795 201 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 EFNB3Q15768 340 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZR03 302 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZNF611Q8N823 705 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MSL2Q9HCI7 577 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PTPN13Q12923 2485 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PLCE1Q9P212 2302 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FAM221AA4D161 298 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ST8SIA3O43173 380 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GZMHP20718 246 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ECI1P42126 302 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 GNB2P62879 340 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 VAMP2P63027 116 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IL24Q13007 206 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CALHM1Q8IU99 346 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 BANF2Q9H503 90 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 DECR2Q9NUI1 292 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 C19orf84I3L1E1 186 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 J3QT63 122 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 HBE1P02100 147 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ADH4P08319 380 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MMP9P14780 707 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TMEM187Q14656 261 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 Q8NFD4 153 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 A0A1W2PP11 408 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ANGPTL7O43827 346 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 PITX3O75364 302 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 PLAUP00749 431 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 SP6Q3SY56 376 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 Q8IYB0 196 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 LRTM2Q8N967 370 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 TBX15Q96SF7 602 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 ZANQ9Y493 2812 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-201ENST00000318129 GRPP07492 148 aa8.51□□□□□ -1.05
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