RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 LYNX1G3V0Z9 82 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-201ENST00000313173 LYNX1P0DP58 116 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-201ENST00000313173 SMUG1Q53HV7 270 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-201ENST00000313173 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-201ENST00000313173 MARC2Q969Z3 335 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-201ENST00000313173 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD8-201ENST00000313173 ZP3P21754 424 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 RAB1BQ9H0U4 201 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 BLOC1S1P78537 153 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf71Q6IPW1 123 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 OR4S2Q8NH73 311 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5SQ99766 215 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 NUDT19A8MXV4 375 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV2-70P01814 119 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 PXDC1Q5TGL8 231 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 SH3BGRL3Q9H299 93 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA4P78363 2273 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 RAB19A4D1S5 217 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGDIBP52566 201 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ERVFRD-1P60508 538 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ERVK-16P61578 105 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 RAB39BQ96DA2 213 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 PARP11Q9NR21 331 aa22■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 KRBOX1C9JBD0 128 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 DFFBO76075 338 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 NQO2P16083 231 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 DLX6P56179 175 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM155Q4W5P6 130 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 STPG2Q8N412 459 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF383Q8NA42 475 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00052Q96N35 136 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 MMP26Q9NRE1 261 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 AARDQ4LEZ3 155 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF843Q8N446 348 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 OR9G9P0C7N8 305 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 DANCRP0C864 163 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 SOD3P08294 240 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 METTL15P1P0C7V9 234 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ATP6V0CP27449 155 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 SPANXN5Q5MJ07 72 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 UQCC3Q6UW78 93 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 IL34Q6ZMJ4 242 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 RAB5CP51148 216 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZRG5 221 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 SSX9Q7RTT3 188 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 HAPLN4Q86UW8 402 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 DTX2Q86UW9 622 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 C8orf31Q8N9H6 132 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 DTD1Q8TEA8 209 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 HRH4Q9H3N8 390 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 ZNRD1Q9P1U0 126 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD8-201ENST00000313173 C1QL1O75973 258 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 HBG1P69891 147 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 HBG2P69892 147 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 BTNL8Q6UX41 500 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 CACFD1Q9UGQ2 172 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 SCO1O75880 301 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 ARL16Q0P5N6 197 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 PJVKQ0ZLH3 352 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM140Q9NV12 185 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 CT45A6P0DMU7 189 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 CT45A5P0DMU8 189 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 CT45A7P0DMV0 189 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 F2RL1P55085 397 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 OR2B8PP59922 312 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF841Q6ZN19 808 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00311Q8N616 119 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 OR4A16Q8NH70 328 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF596Q8TC21 504 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 IFNA5P01569 189 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 AVPI1Q5T686 147 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF525Q8N782 197 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 OR2G3Q8NGZ4 309 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 ZDHHC16Q969W1 377 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 OR4C12Q96R67 309 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087X0M5 115 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GX30 115 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 CEBPZOSA8MTT3 80 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 LYPD6BQ8NI32 183 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 GPR37O15354 613 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 CAMLGP49069 296 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 RELBQ01201 579 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD8-201ENST00000313173 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms