RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 H3BUX3 64 aa14.65□□□□□ -0.06
PTX4-201ENST00000293922 MPPED1O15442 326 aa14.65□□□□□ -0.06
PTX4-201ENST00000293922 TNFSF12O43508 249 aa14.65□□□□□ -0.06
PTX4-201ENST00000293922 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTX4-201ENST00000293922 RAB25P57735 213 aa14.65□□□□□ -0.06
PTX4-201ENST00000293922 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTX4-201ENST00000293922 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.65□□□□□ -0.06
PTX4-201ENST00000293922 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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PTX4-201ENST00000293922 AKR1C4P17516 323 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 KCTD9Q7L273 389 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTX4-201ENST00000293922 RNF114Q9Y508 228 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTX4-201ENST00000293922 CT45A5P0DMU8 189 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 CT45A7P0DMV0 189 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 F2RP25116 425 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTX4-201ENST00000293922 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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PTX4-201ENST00000293922 OR5AC1P0C628 307 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.58□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 ANXA3P12429 323 aa14.58□□□□□ -0.07
PTX4-201ENST00000293922 UCP1P25874 307 aa14.58□□□□□ -0.07
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