RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CALYQ9NYX4 217 aa15.95■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 F2RL2O00254 374 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 HPRT1P00492 218 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 LHX4Q969G2 390 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CEP250Q9BV73 2442 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.94■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 A0A087WWC5 75 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PPE3 182 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 IFNA17P01571 189 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 IFNA4P05014 189 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 S100A6P06703 90 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 UTF1Q5T230 341 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 Q8TCH9 128 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 LEAP2Q969E1 77 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 A8MXE2 369 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 SLC31A2O15432 143 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 MAS1LP35410 378 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 SELENOVP59797 346 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 MALSU1Q96EH3 234 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 SLC25A22Q9H936 323 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 GCM1Q9NP62 436 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 RNF7Q9UBF6 113 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 VAX2Q9UIW0 290 aa15.93■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 C15orf62A8K5M9 175 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 IFNA1P01562 189 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 IGHV1-46P01743 117 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 GATA4P43694 442 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CD40P25942 277 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 FAM222BQ8WU58 562 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 NPCDR1Q9BY65 106 aa15.92■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 ZNF98A6NK75 572 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 GNB2P62879 340 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 VWC2Q2TAL6 325 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 DEFB108BQ8NET1 73 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 OR4A16Q8NH70 328 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 S1PR3Q99500 378 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 P2RX4Q99571 388 aa15.91■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 C5orf52A6NGY3 159 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CGB3P0DN86 165 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CGB7P0DN87 165 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CCKARP32238 428 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 ERVK-16P61578 105 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 OR10G9Q8NGN4 311 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 OR10G7Q8NGN6 311 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 C12orf57Q99622 126 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 IL19Q9UHD0 177 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 MBP02144 154 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 STUMQ69YW2 141 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 ZNF709Q8N972 641 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa15.9■□□□□ 0.14
USP21-201ENST00000289865 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.136e-11■■■□□ 18
USP21-201ENST00000289865 AARDQ4LEZ3 155 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 Q8WTZ3 238 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 SDSLQ96GA7 329 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 NQO2P16083 231 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 RPS10P46783 165 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 RAB7AP51149 207 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 SPCS3P61009 180 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 GAFA1Q96PS6 74 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 BSNQ9UPA5 3926 aa15.89■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 DYSFO75923 2080 aa15.88■□□□□ 0.13
USP21-201ENST00000289865 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms