RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 OR51G1Q8NGK1 321 aa23.34■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 ANAPC16Q96DE5 110 aa23.34■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 UFSP2Q9NUQ7 469 aa23.34■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 VENTXO95231 258 aa23.33■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 PDZD11Q5EBL8 140 aa23.33■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 METRNQ9UJH8 293 aa23.33■■□□□ 1.33
UBP1-201ENST00000283628 C15orf65H3BRN8 121 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 WISP2O76076 250 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GALR1P47211 349 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 IGF2-ASQ6U949 168 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 C1orf174Q8IYL3 243 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PRSS33Q8NF86 280 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 OR4X1Q8NH49 305 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 R3HDM4Q96D70 268 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GWJ7 208 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 ST8SIA5O15466 376 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 CECR9P0C854 216 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 FABP4P15090 132 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GCH1P30793 250 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 TMEM249Q2WGJ8 235 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 SNX22Q96L94 193 aa23.32■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 C15orf62A8K5M9 175 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 TFF1P04155 84 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-43DP0DP04 118 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 TPRX1Q8N7U7 411 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GFOD1Q9NXC2 390 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PTPRBP23467 1997 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 AQP7O14520 342 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 NKX2-8O15522 239 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 FOXF2Q12947 444 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GATAD1Q8WUU5 269 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 WDR83OSQ9Y284 106 aa23.31■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PAGE4O60829 102 aa23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 HRASP01112 189 aa23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 IGLV1-44P01699 117 aa23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 RPP30P78346 268 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 TMEM183AQ8IXX5 376 aa23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 RFESDQ8TAC1 157 aa23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 MSL2Q9HCI7 577 aa23.3■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PPP5D1E7EU14 171 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GPR12P47775 334 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 FABP6P51161 128 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 VWA1Q6PCB0 445 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 CD177Q8N6Q3 437 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GAB2Q9UQC2 676 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 HPRT1P00492 218 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GYPAP02724 150 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 DUTP33316 252 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 CDPF1Q6NVV7 123 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 LRRC29Q8WV35 223 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 RAB1CQ92928 201 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PRDM13Q9H4Q3 707 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 OR6C3Q9NZP0 311 aa23.29■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 DEFB108AA8MXU0 73 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 MPDU1O75352 247 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 GZMHP20718 246 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 CD1BP29016 333 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PRDX2P32119 198 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 RPS16P62249 146 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 SPINK9Q5DT21 86 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 Q8N7P7 452 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H2BLQ99880 126 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 JPT1Q9UK76 154 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PLA2G5P39877 138 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 C9orf106Q8NAJ2 232 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 NECAP1Q8NC96 275 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 FZR1Q9UM11 496 aa23.28■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 C11orf94C9JXX5 98 aa23.27■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 PDE6DO43924 150 aa23.27■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 OR9G9P0C7N8 305 aa23.27■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 SRP14P37108 136 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 LINC00205P59089 165 aa23.27■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 SPCS3P61009 180 aa23.27■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 FAM90A1Q86YD7 464 aa23.27■■□□□ 1.32
UBP1-201ENST00000283628 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa23.27■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa23.26■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 WT1P19544 449 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 OR52E5Q8NH55 327 aa23.26■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa23.26■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.312e-10■□□□□ 9.6
UBP1-201ENST00000283628 TLE1Q04724 770 aa23.26■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 SARAFQ96BY9 339 aa23.26■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 DOCK11Q5JSL3 2073 aa23.25■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 RD3LP0DJH9 198 aa23.25■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 EDDM3AQ14507 147 aa23.25■■□□□ 1.31
UBP1-201ENST00000283628 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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