RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CACNA1AO00555 2505 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 BMPR1BO00238 502 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 HTN3P15516 51 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PMCHP20382 165 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF137PP52743 207 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 TCF15Q12870 199 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 BTN1A1Q13410 526 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 OR2C3Q8N628 320 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF524Q96C55 264 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 LYZL4Q96KX0 146 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 C16orf92Q96LL3 132 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 TINAGQ9UJW2 476 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV1-2P23083 117 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 STARD4Q96DR4 205 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 TNFRSF14Q92956 283 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 C5orf52A6NGY3 159 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CDIPTO14735 213 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 G6PCP35575 357 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF154Q13106 437 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SYT8Q8NBV8 401 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SERF2P84101 59 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 VWA1Q6PCB0 445 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CST7O76096 145 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 MPV17P39210 176 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF738Q8NE65 137 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CGB1A6NKQ9 187 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ERVK11-1P61568 191 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CCL8P80075 99 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PSG7Q13046 419 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 GAPTQ8N292 157 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R2P9O14990 202 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PTHLHP12272 177 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 MEOX2P50222 304 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPN3-201ENST00000262539 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 FAM222BQ8WU58 562 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 R3HDM4Q96D70 268 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 MC5RP33032 325 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 WNT5AP41221 380 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 GALR1P47211 349 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SULT1A1P50225 295 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 HARBI1Q96MB7 349 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ODAMA1E959 279 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SYNGR2O43760 224 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF250P15622 560 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CXCL3P19876 107 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SP6Q3SY56 376 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 Q8TCH9 128 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 CACNA1GO43497 2377 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 RPEL1Q2QD12 228 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PRNDQ9UKY0 176 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PPE3 182 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 WNT9BO14905 357 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 FSTL3O95633 263 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 HPRT1P00492 218 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 GCGP01275 180 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 PRDX2P32119 198 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPN3-201ENST00000262539 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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