RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYAAP02489 173 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGC2P03986 189 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SOD3P08294 240 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 HBG1P69891 147 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 HBG2P69892 147 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5A2Q8NGI9 324 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10D4PQ8NGN7 298 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 HAAOP46952 286 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB11AP62491 216 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T2Q6IF00 324 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SPNS3Q6ZMD2 512 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SDF2L1Q9HCN8 221 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 VAX2Q9UIW0 290 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf36Q3SXR2 165 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF880Q6PDB4 577 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 VHLLQ6RSH7 139 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OR56B2PQ8NGI1 322 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NEK7Q8TDX7 302 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR146Q96CH1 333 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CABLES2Q9BTV7 478 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51B6Q9H340 312 aa21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR10J5Q8NHC4 309 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 SSTP61278 116 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MSMPQ1L6U9 139 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 RPRMQ9NS64 109 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMP3Q9UQV4 416 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGC1P0CF51 173 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PKIAP61925 76 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 GPM6AP51674 278 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM41BQ5BJD5 291 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5R1Q8NH85 324 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 POM121L2Q96KW2 1035 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM9Q9Y5J7 89 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 MOB1BQ7L9L4 216 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 UFSP2Q9NUQ7 469 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf49A4QMS7 147 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 FRZBQ92765 325 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TSTD3H0UI37 97 aa21.92■■□□□ 1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 WNT5AP41221 380 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH20Q9HBT6 801 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PSENENQ9NZ42 101 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT8Q9UHE5 227 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP92A6NM28 416 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CD300LBA8K4G0 201 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PHOX2AO14813 284 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF573Q86YE8 665 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10V1Q8NGI7 309 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL19Q99731 98 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FZR1Q9UM11 496 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5B21A6NL26 309 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADIPOQQ15848 244 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR10A7Q8NGE5 316 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SRD5A3Q9H8P0 318 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 MPC1Q9Y5U8 109 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D28Q2M2D7 210 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF665Q9H7R5 613 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPR3Q14573 2671 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JRQ6 117 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SMCO3A2RU48 225 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 NGFP01138 241 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG2P11465 335 aa21.9■■□□□ 1.1
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