RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SCN9A	Q15858	1988 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GPX1	P07203	203 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	UCP3	P55916	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PRSS8	Q16651	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015		Q6ZT83	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	CA2	P00918	260 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	AMY1A	P04745	511 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RNF224	P0DH78	156 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	UBE2V2	Q15819	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	NUDT3	O95989	172 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PKIA	P61925	76 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PCOLCE	Q15113	449 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM54	Q969K7	222 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC25A17	O43808	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	MRAP2	Q96G30	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GPR82	Q96P67	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TIMP4	Q99727	224 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RAX	Q9Y2V3	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	EFNB2	P52799	333 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IGSF11	Q5DX21	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FGFRL1	Q8N441	504 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PRO1933	Q9H354	126 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	LAMB2	P55268	1798 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GLRX	P35754	106 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	HCP5	Q6MZN7	132 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A087X0M5	115 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A1B0GX30	115 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	THY1	P04216	161 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SCGB1A1	P11684	91 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	CEACAM1	P13688	526 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	AQP3	Q92482	292 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SPSB4	Q96A44	273 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	CA7	P43166	264 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	NMU	P48645	174 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FXYD3	Q14802	87 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM101	Q96IK0	257 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	NPFF	O15130	113 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TAF1	P21675	1872 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SCT	P09683	121 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SPINK2	P20155	84 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TAS2R60	P59551	318 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM206A	Q9NX38	181 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GDF9	O60383	454 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GHRH	P01286	108 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PLAUR	Q03405	335 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	LNP1	A1A4G5	178 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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