RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC58	Q4VC31	144 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MARCH3	Q86UD3	253 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PNKD	Q8N490	385 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		Q96M85	177 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SOST	Q9BQB4	213 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A4	Q9H015	551 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MOK	Q9UQ07	419 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL6IP5	O75915	188 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFAND5	O76080	213 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB3D	O95716	219 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CSF3	P09919	207 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ELK1	P19419	428 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	BTC	P35070	178 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMP3	P35625	211 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	INPP1	P49441	399 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CEBPG	P53567	150 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R31	P59538	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF117	Q03924	483 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIQK	Q629K1	86 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HBM	Q6B0K9	141 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF544	Q6NX49	715 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZVH6	145 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP14	Q86UN6	197 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N402	240 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5J2	Q8NH18	312 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMF1	Q92530	271 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FGGY	Q96C11	551 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GNG8	Q9UK08	70 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA1G	O43497	2377 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PRG6	482 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		H0Y980	276 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		H7C1H1	209 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	XKRY	O14609	159 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PDCD5	O14737	125 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2G10	O15496	165 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T1	O43869	369 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FADS1	O60427	444 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNK	O75909	580 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MELTF	P08582	738 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB3B	P20337	219 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZP3	P21754	424 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD11B1	P28845	292 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CHRNB4	P30926	498 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	P2RX1	P51575	399 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN12	P56749	244 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CD164	Q04900	197 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CD300C	Q08708	224 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CLINT1	Q14677	625 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK5R1	Q15078	307 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	QPRT	Q15274	297 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SGCA	Q16586	387 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		3.81	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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