RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	NECAP1	Q8NC96	275 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PIGT	Q969N2	578 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	SPSB1	Q96BD6	273 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CHODL	Q9H9P2	273 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PPBP	P02775	128 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	AADAC	P22760	399 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PTTG1IP	P53801	180 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1CB	P62140	327 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	NMS	Q5H8A3	153 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659		K7EM74	188 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CCL2	P13500	99 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS12	P56730	875 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF154	Q13106	437 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM42	Q69YG0	159 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659		A8MXE2	369 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ADAM20	O43506	726 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TOMM40	O96008	361 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	NRAS	P01111	189 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	HNF1A	P20823	631 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	HBG1	P69891	147 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	HBG2	P69892	147 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TGFBR3	Q03167	851 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	FOXL1	Q12952	345 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PPY	P01298	95 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV1-2	P23083	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	MALL	Q13021	153 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	MDP1	Q86V88	176 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ARID1A	O14497	2285 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CHST1	O43916	411 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	UBE2V1	Q13404	147 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF726P1	Q15940	193 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	BATF	Q16520	125 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZT83	130 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PARL	Q9H300	379 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	GYPA	P02724	150 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	IL3RA	P26951	378 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	FUT6	P51993	359 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	MORN2	Q502X0	79 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	VWA1	Q6PCB0	445 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	PIGC	Q92535	297 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	CORO2A	Q92828	525 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	LHX4	Q969G2	390 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	FAM122A	Q96E09	287 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	BORCS8	Q96FH0	119 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	DKK4	Q9UBT3	224 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM50A	O95807	157 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	OPRM1	P35372	400 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	WNT5A	P41221	380 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZS49	121 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	RNF2	Q99496	336 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		F6UZH7	168 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	HS3ST1	O14792	307 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	LILRA1	O75019	489 aa		12.9	□□□□□ -0.35

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