RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610365.4

CYFIP1-203, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 4,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-203ENST00000610365 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 LRP5LA4QPB2 252 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 H0Y980 276 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 CRYGSP22914 178 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 TCF23Q7RTU1 214 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 FADS6Q8N9I5 356 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 OR1L1Q8NH94 360 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 TRANK1O15050 2925 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 A0A1B0GU03 582 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 C9orf172C9J069 976 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 LYZL6O75951 148 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 TFF3Q07654 80 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 FOXO1Q12778 655 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.47□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 F6UZH7 168 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 FCGR3BO75015 233 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 COX6A1P12074 109 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 CTSSP25774 331 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 SSTP61278 116 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 PPP1CBP62140 327 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 PAX5Q02548 391 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 HIST3H3Q16695 136 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 IMMP2LQ96T52 175 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 ENY2Q9NPA8 101 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 B4DEV8 164 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 ST8SIA5O15466 376 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 AMBPP02760 352 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 OR8B8Q15620 311 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 SSX7Q7RTT5 188 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 OR4A16Q8NH70 328 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 BTF3L4Q96K17 158 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 TBX15Q96SF7 602 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 AKAP6Q13023 2319 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.46□□□□□ -1.05
CYFIP1-203ENST00000610365 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 SH2D1BO14796 132 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 SLC31A2O15432 143 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 UMODP07911 640 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 TCF15Q12870 199 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 PRSS8Q16651 343 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 DTD1Q8TEA8 209 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 GALMQ96C23 342 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 TIMD4Q96H15 378 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 TMEM56Q96MV1 263 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 LRRC30A6NM36 301 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF525Q8N782 197 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 LRTM2Q8N967 370 aa8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 RAMP3O60896 148 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 PMCHP20382 165 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 ZNF83P51522 516 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 IQCJQ1A5X6 159 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 WNT9BO14905 357 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 TGOLN2O43493 480 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 OR2H2O95918 312 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 KLRB1Q12918 225 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 NMSQ5H8A3 153 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 PRR31Q5SQ13 230 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.45□□□□□ -1.06
CYFIP1-203ENST00000610365 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142 ms