RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.74□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 JTBO76095 146 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 IAPPP10997 89 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 ARR3P36575 388 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 LYG1Q8N1E2 194 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 SCCPDHQ8NBX0 429 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 CHST1O43916 411 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 GCGP01275 180 aa12.73□□□□□ -0.37
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CTIF-205ENST00000587860 Q6ZRM9 215 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 OR5C1Q8NGR4 320 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 TRDCB7Z8K6 153 aa12.72□□□□□ -0.37
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CTIF-205ENST00000587860 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
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CTIF-205ENST00000587860 GNG3P63215 75 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 OR5A2Q8NGI9 324 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 OR1P1Q8NH06 330 aa12.72□□□□□ -0.37
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CTIF-205ENST00000587860 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 OBP2BQ9NPH6 170 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 ZFP30Q9Y2G7 519 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 TUSC2O75896 110 aa12.72□□□□□ -0.37
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CTIF-205ENST00000587860 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 IQCJQ1A5X6 159 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 CLEC12BQ2HXU8 276 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 NKX6-3A6NJ46 265 aa12.72□□□□□ -0.37
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CTIF-205ENST00000587860 PRRX1P54821 245 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 PPP1CBP62140 327 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 C1orf194Q5T5A4 169 aa12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CTIF-205ENST00000587860 NUDT11Q96G61 164 aa12.72□□□□□ -0.37
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CTIF-205ENST00000587860 TUBG1P23258 451 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 COL10A1Q03692 680 aa12.7□□□□□ -0.38
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CTIF-205ENST00000587860 TDRG1Q3Y452 100 aa12.7□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 SPINK9Q5DT21 86 aa12.7□□□□□ -0.38
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CTIF-205ENST00000587860 TAAR5O14804 337 aa12.7□□□□□ -0.38
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CTIF-205ENST00000587860 METRNQ9UJH8 293 aa12.7□□□□□ -0.38
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CTIF-205ENST00000587860 ATP6V1FQ16864 119 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D28Q2M2D7 210 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 C1orf87Q8N0U7 546 aa12.69□□□□□ -0.38
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CTIF-205ENST00000587860 C9orf106Q8NAJ2 232 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 SERPINE2P07093 398 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 FTH1P19P0C7X4 201 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 MMP9P14780 707 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CTIF-205ENST00000587860 TMEM108Q6UXF1 575 aa12.69□□□□□ -0.38
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