RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-210	ENST00000580357	RTL8B	Q17RB0	113 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TEX38	Q6PEX7	206 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	RITA1	Q96K30	269 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	FAM25A	B3EWG3	89 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	FAM25C	B3EWG5	89 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	FAM25G	B3EWG6	89 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	SULT1C2	O00338	296 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	HPGDS	O60760	199 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	NAT1	P18440	290 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	CDK10	Q15131	360 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	MSMO1	Q15800	293 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	OR51J1	Q9H342	316 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	PTHLH	P12272	177 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ELK1	P19419	428 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	VDAC1	P21796	283 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	CNTFR	P26992	372 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	SLC6A1	P30531	599 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	FCGR2C	P31995	323 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TAS2R46	P59540	309 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	BORCS5	Q969J3	196 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		12.94	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1-16	P04430	117 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ELANE	P08246	267 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	PSG5	Q15238	335 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM177	Q53S58	311 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF329	Q86UD4	541 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	BVES	Q8NE79	360 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	GPX8	Q8TED1	209 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	R3HDM4	Q96D70	268 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	FBXL15	Q9H469	300 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357		J3QRK9	145 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	SHOX	O15266	292 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TSPAN15	O95858	294 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	PPY	P01298	95 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	LINC00205	P59089	165 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	FOXE3	Q13461	319 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	SPCS2	Q15005	226 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	DDB2	Q92466	427 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	SNAPC3	Q92966	411 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		12.92	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	RGS5	O15539	181 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	IGHG4	P01861	327 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	AADAC	P22760	399 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	CX3CL1	P78423	397 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	DYRK1A	Q13627	763 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TEX45	Q8NA69	505 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	HARBI1	Q96MB7	349 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	EHF	Q9NZC4	300 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	LINC00473	A8K010	186 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	RCVRN	P35243	200 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	KIR2DS2	P43631	304 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	HERV-K104	P61576	105 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM65	Q6PI78	240 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	MFSD4A	Q8N468	514 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	RNF152	Q8N8N0	203 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IFT20-210	ENST00000580357	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		12.9	□□□□□ -0.34

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