RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PELI1Q96FA3 418 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 C4orf36Q96KX1 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 IL36GQ9NZH8 169 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 KMT2AQ03164 3969 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR11H12B2RN74 326 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 G3V2T6 193 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR3A3P47888 321 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 GNMTQ14749 295 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 LAX1Q8IWV1 398 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 THTPAQ9BU02 230 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 JAM3Q9BX67 310 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 JPT1Q9UK76 154 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 RNF24Q9Y225 148 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 TNCP24821 2201 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-210ENST00000578916 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM212A6NML5 194 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 F8WDY8 70 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 H3BUA1 57 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 H7C2Y5 167 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CTDSP2O14595 271 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TSPAN4O14817 238 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 DEDDO75618 318 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CA2P00918 260 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CD7P09564 240 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GTF2F2P13984 249 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RAB4AP20338 218 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SOX2P48431 317 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FLOT2Q14254 428 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GPR176Q14439 515 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RPEL1Q2QD12 228 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF529Q6P280 563 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PEMTQ9UBM1 199 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SPATA2Q9UM82 520 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PP11 408 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 J3QRE1 110 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SLC22A1O15245 554 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 AIREO43918 545 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 YPEL1O60688 119 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 STAG3L2P0CL84 134 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 AADACP22760 399 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 MC5RP33032 325 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FHITP49789 147 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PPP3R1P63098 170 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GUCA2BQ16661 112 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 DDI2Q5TDH0 399 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 YPEL2Q96QA6 119 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RNF5Q99942 180 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0J9YWU9 116 aa6.87□□□□□ -1.31
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