RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 CNIH2Q6PI25 160 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 Q6ZR03 302 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC121Q6ZUS5 278 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 FAM122BQ7Z309 247 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 MICU2Q8IYU8 434 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM86BQ8N661 226 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 COMMD1Q8N668 190 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CLDN22Q8N7P3 220 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OR8B3Q8NGG8 313 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OR11L1Q8NGX0 322 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35E1Q96K37 410 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 Q96M85 177 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OR8B2Q96RD0 313 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 RARRES2Q99969 163 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 HDHD2Q9H0R4 259 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 BEX1Q9HBH7 125 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM100Q9NV29 134 aa4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 FXYD1O00168 92 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 PHYHO14832 338 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 FFAR1O14842 300 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 RER1O15258 196 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CHST1O43916 411 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 GMDSO60547 372 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ATP5HO75947 161 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CTLA4P16410 223 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SMIM11AP58511 58 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H3AP68431 136 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 DEFA6Q01524 100 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 DGCR6Q14129 220 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF79Q15937 498 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 MESTQ5EB52 335 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OR2T2Q6IF00 324 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SPERTQ8NA61 448 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SLC29A1Q99808 456 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SAR1AQ9NR31 198 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CLN8Q9UBY8 286 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0G2JLM5 398 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF879B4DU55 563 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 F5H5P2 479 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 H7C1C5 153 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CXCR6O00574 342 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CDC42EP2O14613 210 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC22O60826 627 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF682O95780 498 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 IFNGR2P38484 337 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CD200P41217 278 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 GPR4P46093 362 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 WNT4P56705 351 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 FGF12P61328 243 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 LCN6P62502 163 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 LIPEQ05469 1076 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 RFX4Q33E94 735 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SMARCD3Q6STE5 483 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OR5AS1Q8N127 324 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SLC7A13Q8TCU3 470 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SPTSSAQ969W0 71 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OSBPL10Q9BXB5 764 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SYT4Q9H2B2 425 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 OR51M1Q9H341 326 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 RERGLQ9H628 205 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 CMTM6Q9NX76 183 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 PTTG3PQ9NZH4 202 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ING4Q9UNL4 249 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 ENPP4Q9Y6X5 453 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms