RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554102.5

SPATA7-208, Transcript of spermatogenesis associated 7, human

TSL 3

Gene SPATA7, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA7-208	ENST00000554102	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	ECI1	P42126	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	KIR2DS2	P43631	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102		Q8N402	240 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	C16orf95	Q9H693	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102		H0YJW9	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CD74	P04233	296 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CD3D	P04234	171 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	MMD	Q15546	238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	KCTD9	Q7L273	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	POC5	Q8NA72	575 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	NBR2	O15453	112 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CHST1	O43916	411 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	SPDEF	O95238	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	AMY2A	P04746	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	LGALS7	P47929	136 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	UCP3	P55916	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	PLGLA	Q15195	96 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102		Q6ZSV7	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102		Q8N6K4	173 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	PRRT1	Q99946	306 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102		V9GYH0	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SPATA7-208	ENST00000554102	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102		M0QYG6	137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	GPR31	O00270	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	KCNAB3	O43448	404 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	PGAM2	P15259	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	BVES	Q8NE79	360 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	OR4S2	Q8NH73	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	SHOX	O15266	292 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	PROP1	O75360	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102		Q8N2B8	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	C3orf56	Q8N813	242 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	NPB	Q8NG41	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	HARBI1	Q96MB7	349 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	ATR	Q13535	2644 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SPATA7-208	ENST00000554102	CENPX	A8MT69	81 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms