RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 FAM46BQ96A09 425 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5A-211ENST00000544777 NSL1Q96IY1 281 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5A-211ENST00000544777 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
KDM5A-211ENST00000544777 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5A-211ENST00000544777 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5A-211ENST00000544777 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5A-211ENST00000544777 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM212A6NML5 194 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 DEFB4AO15263 64 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 GLAP06280 429 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 DDI2Q5TDH0 399 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 NECAP1Q8NC96 275 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 OR4A5Q8NH83 315 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 RFKQ969G6 155 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ASB9Q96DX5 294 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 C4orf36Q96KX1 117 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CSTL1Q9H114 145 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 MPTX1A8MV57 137 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 A8MWP6 167 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV2-23P01705 113 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CRYGBP07316 175 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 FUT3P21217 361 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ARL3P36405 182 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CAPGP40121 348 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SOX2P48431 317 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 C15orf32Q32M92 178 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF383Q8NA42 475 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 OR5B3Q8NH48 314 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 MARC2Q969Z3 335 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 NRBF2Q96F24 287 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 RNF126Q9BV68 326 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ITGB1BP1O14713 200 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 OR2J3O76001 311 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 BAG2O95816 211 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CD2P06729 351 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 BDKRB2P30411 391 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ADMP35318 185 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00205P59089 165 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 PPP3R1P63098 170 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 HMGN3Q15651 99 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 TNXAQ16473 311 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF585BQ52M93 769 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 OR14A2Q96R54 314 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 AGMATQ9BSE5 352 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 HRH4Q9H3N8 390 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.44□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 TSPAN4O14817 238 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 PROP1O75360 226 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 C8orf88P0DMB2 117 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 HLA-DMBP28068 263 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 MED21Q13503 144 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SETD9Q8NE22 299 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 HARBI1Q96MB7 349 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 BANF2Q9H503 90 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF221Q9UK13 617 aa7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 B2RBV5 119 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 PDCD6O75340 191 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 S1PR2O95136 353 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-23P01764 117 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 CBX3Q13185 183 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 Q6ZR54 194 aa7.42□□□□□ -1.22
KDM5A-211ENST00000544777 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms