RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 MMDQ15546 238 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 ZNF585BQ52M93 769 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 AAED1Q7RTV5 226 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 LRP11Q86VZ4 500 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 BORCS7Q96B45 105 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 APH1AQ96BI3 265 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 OR6C1Q96RD1 312 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 LAMA3Q16787 3333 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 WDR1O75083 606 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 S1PR2O95136 353 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 OR10J4P0C629 311 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 LIFP15018 202 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 HNF1AP20823 631 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CBLN1P23435 193 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TNFSF4P23510 183 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CD27P26842 260 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 OPRK1P41145 380 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 AMTP48728 403 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 PRRX1P54821 245 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 RHOBP62745 196 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 C11orf52Q96A22 123 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 PKIBQ9C010 78 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 NRN1Q9NPD7 142 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 DPRXA6NFQ7 191 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 SNURFLB1AK76 121 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CCL25O15444 150 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 HLA-DQA1P01909 254 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 RAC2P15153 192 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TFPI2P48307 235 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 LINC00310P59036 64 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TDRG1Q3Y452 100 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 STUMQ69YW2 141 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TCF23Q7RTU1 214 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 Q8IYB0 196 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 STPG4Q8N801 248 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 OR1K1Q8NGR3 316 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TAAR6Q96RI8 345 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 RP1P56715 2156 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 REV3LO60673 3130 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 C5orf42Q9H799 3197 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 A0A1B0GUS0 222 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TRAPPC6AO75865 159 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 NDUFB8O95169 186 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CLDN14O95500 239 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 P0C879 139 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 B4GALT1P15291 398 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 AREGP15514 252 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 ATP5G3P48201 142 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 GPM6AP51674 278 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TFF3Q07654 80 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IGFBP7Q16270 282 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 FBLN7Q53RD9 439 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 RASL11AQ6T310 242 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 SGCZQ96LD1 299 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 UCN2Q96RP3 112 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PR77 199 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IFNL4K9M1U5 179 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms