RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q5VSD8 79 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4A47Q6IF82 309 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF383Q8NA42 475 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8NAQ8 132 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NECAP1Q8NC96 275 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALMQ96C23 342 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MWP6 167 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAG2O95816 211 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV2-23P01705 113 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADMP35318 185 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TFPI2P48307 235 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRISP1P54107 249 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF85Q03923 595 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASCL4Q6XD76 172 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SETD9Q8NE22 299 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM163Q8TC26 289 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF213Q63HN8 5207 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN4O14817 238 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC22O60826 627 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOA2P02652 100 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYGBP07316 175 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF2F2P13984 249 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPA2P15927 270 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOX2P48431 317 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GK3PQ14409 553 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB9Q96DX5 294 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MDFICQ9P1T7 246 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CELA1Q9UNI1 258 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4C46A6NHA9 309 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3QLW9 94 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PROP1O75360 226 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD74P04233 296 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8orf88P0DMB2 117 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF19P17023 458 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP10-2P60368 255 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C12orf74Q32Q52 190 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM209BQ5JX69 171 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDPNQ86YL7 162 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GID4Q8IVV7 300 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAPTQ8N292 157 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRZBQ92765 325 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARC2Q969Z3 335 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HARBI1Q96MB7 349 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL36GQ9NZH8 169 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC3BP05452 202 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA8P13928 327 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCR9P51686 369 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BANF2Q9H503 90 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMX3A6NHT5 357 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R1X1 148 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPX5O75715 221 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFNB1P98172 346 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDI2Q5TDH0 399 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FDX2Q6P4F2 183 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf223Q8N319 242 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SETD6Q8TBK2 473 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGMATQ9BSE5 352 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms