RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.96□□□□□ -1.29
RNPC3-208ENST00000533099 MED13Q9UHV7 2174 aa6.96□□□□□ -1.29
RNPC3-208ENST00000533099 ODAMA1E959 279 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 OR5B21A6NL26 309 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 M0R1B8 84 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 C1QTNF9P0C862 333 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 IER3P46695 156 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 UCP3P55916 312 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TNFRSF9Q07011 255 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 SSPNQ14714 243 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 FXYD3Q14802 87 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 R3HDM4Q96D70 268 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 FAM122AQ96E09 287 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 A8MXE2 369 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 FCN1O00602 326 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TCAPO15273 167 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 CA11O75493 328 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 NAPSAO96009 420 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 IGKV1-5P01602 117 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 CBLN1P23435 193 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 REG1BP48304 166 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 RAB31Q13636 194 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 DCAF10Q5QP82 559 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 OR1P1Q8NH06 330 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TMEM56Q96MV1 263 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 S1PR3Q99500 378 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TPPP3Q9BW30 176 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.96□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 K7ESF4 209 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PLAUP00749 431 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PRSS8Q16651 343 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 NMSQ5H8A3 153 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TECTBQ96PL2 329 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TAAR9Q96RI9 348 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TXN2Q99757 166 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 C12orf77C9JDV5 145 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PKIAP61925 76 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 Q6ZPA2 131 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ATOH7Q8N100 152 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 TBX15Q96SF7 602 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 IGHEP01854 428 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 IRF2P14316 349 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF766Q5HY98 468 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 COL6A3P12111 3177 aa6.95□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PSPNO60542 156 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 FOLR2P14207 255 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PAX9P55771 341 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 PAX5Q02548 391 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 OR5G3P0C626 314 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 MPV17P39210 176 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 CAMPP49913 170 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.94□□□□□ -1.3
RNPC3-208ENST00000533099 C1QL4Q86Z23 238 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms