RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 RNF212BA8MTL3 300 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM250H0YL14 139 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SLC31A1O15431 190 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 UTS2O95399 124 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CTXN2P0C2S0 81 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GABRA2P47869 451 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NDUFB4O95168 129 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TIAF1O95411 115 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CELA3BP08861 270 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ESDP10768 282 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CD99P14209 185 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NPBWR2P48146 333 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF83P51522 516 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MFAP5Q13361 173 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ACSM6Q6P461 480 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF525Q8N782 197 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 AKAP13Q12802 2813 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SNURFLB1AK76 121 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MLNRO43193 412 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PPYP01298 95 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 IGLL1P15814 213 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SLC35B1P78383 322 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF90Q03938 601 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NSDHLQ15738 373 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PIGYQ3MUY2 71 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NMSQ5H8A3 153 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MED12LQ86YW9 2145 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR4C12Q96R67 309 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TM2D1Q9BX74 207 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 A0A1W2PS18 150 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 C11orf94C9JXX5 98 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR1D4P47884 311 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 LGALS7P47929 136 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ATP5G3P48201 142 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FUT6P51993 359 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NXPH1P58417 271 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1CAP62136 330 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GNB1P62873 340 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PSG9Q00887 426 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MUC21Q5SSG8 566 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RAET1LQ5VY80 246 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 VWA1Q6PCB0 445 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GAPTQ8N292 157 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SPIN2AQ99865 258 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.93□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MS4A18H0YCH9 400 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NUDT3O95989 172 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NRASP01111 189 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 KRASP01116 189 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CEACAM5P06731 702 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CD3EP07766 207 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SELENOVP59797 346 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ARG2P78540 354 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FOXL1Q12952 345 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 Q56UQ5 140 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MUC15Q8N387 334 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF721Q8TF20 911 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SFRP2Q96HF1 295 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 LYZL4Q96KX0 146 aa6.92□□□□□ -1.3
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