RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF492Q9P255 531 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 NUP160Q12769 1436 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 G3V2T6 193 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 APOMO95445 188 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CCNE2O96020 404 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 IGLV3-25P01717 112 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 HLA-DQB2P05538 268 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CNTFRP26992 372 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PHBP35232 272 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PSPHP78330 225 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 SPCS2Q15005 226 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 IL17AQ16552 155 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 Q8N976 141 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 NRTNQ99748 197 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PARVBQ9HBI1 364 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC12Q9UKB3 198 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 COQ4Q9Y3A0 265 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ATRXP46100 2492 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CECR2Q9BXF3 1484 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 A6NDX4 124 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CDRT1O95170 752 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 FSTL3O95633 263 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CRYZL1O95825 349 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 IGLV3-27P01718 113 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 OPN1SWP03999 348 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 SPI1P17947 270 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 GZMHP20718 246 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CDK2P24941 298 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CRABP2P29373 138 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 OR10J1P30954 320 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 GLRXP35754 106 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TPI1P60174 286 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ESRRGP62508 458 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 C12orf74Q32Q52 190 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC58Q4VC31 144 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 LRP11Q86VZ4 500 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 Q8N9W7 124 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ROPN1LQ96C74 230 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PDXPQ96GD0 296 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 MS4A8Q9BY19 250 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 MED29Q9NX70 200 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TSPOAP1O95153 1857 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 A8MWL6 223 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 OR7C2O60412 319 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 OR10J4P0C629 311 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CPMP14384 443 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 CA7P43166 264 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 LHX2P50458 406 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 NUDT2P50583 147 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 DAPP51397 102 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PDGFRLQ15198 375 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 DEFB115Q30KQ5 88 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 LUZP6Q538Z0 58 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 BAP18Q8IXM2 172 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 OSR2Q8N2R0 312 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms