RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	SLAMF1	Q13291	335 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	PMS2P3	Q13401	168 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	LCN8	Q6JVE9	175 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	PPCDC	Q96CD2	204 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	MRO	Q9BYG7	248 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR51B6	Q9H340	312 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	DSCAM	O60469	2012 aa		0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ERICH2	A1L162	156 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268		A8MUN3	132 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	UCHL1	P09936	223 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CCR2	P41597	374 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TMEM33	P57088	247 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	BTN3A2	P78410	334 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	GNA13	Q14344	377 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	C4orf26	Q17RF5	130 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	LFNG	Q8NES3	379 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268		Q8WTZ3	238 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	EMC3	Q9P0I2	261 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SCN9A	Q15858	1988 aa		0.81	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268		M0R381	172 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CCRL2	O00421	344 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	AZIN1	O14977	448 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	STX10	O60499	249 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ATP5G1	P05496	136 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	GABRA2	P47869	451 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	GLO1	Q04760	184 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR10D3	Q8NH80	312 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	SFRP2	Q96HF1	295 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NMNAT3	Q96T66	252 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	BBS2	Q9BXC9	721 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CFAP45	Q9UL16	551 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	GRIN2B	Q13224	1484 aa		0.8	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	GOLGA8R	I6L899	631 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	BHLHE40	O14503	412 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	KLRC4	O43908	158 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NDUFB2	O95178	105 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NPY	P01303	97 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	ORM1	P02763	201 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	HLA-DQB2	P05538	268 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	LYNX1	P0DP58	116 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CXCL2	P19875	107 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CXCL3	P19876	107 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CD24	P25063	80 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	MIP	P30301	263 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CTBP2	P56545	445 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CLDN12	P56749	244 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	C8orf4	Q9NR00	106 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
USP34-222	ENST00000498268	LAMB2	P55268	1798 aa		0.78	□□□□□ -2.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms