RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 H7C2Y5 167 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 FAAHO00519 579 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 RDH16O75452 317 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 STK16O75716 305 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 UBL3O95164 117 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 GADD45GO95257 159 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 OPN1SWP03999 348 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CTSLP07711 333 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DUX4L2P0CJ85 424 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DUX4L3P0CJ86 424 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DUX4L5P0CJ88 424 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DUX4L6P0CJ89 424 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DUX4L7P0CJ90 424 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SMIM6P0DI80 62 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CCL4P13236 92 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 RAB3BP20337 219 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 OMGP23515 440 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 F2RP25116 425 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 PAX6P26367 422 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 S100A11P31949 105 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CEACAM3P40198 252 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CD79BP40259 229 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CSKP41240 450 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 OR1E2P47887 323 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CSNK1A1P48729 337 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 PPOXP50336 477 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 XKP51811 444 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 RND2P52198 227 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 PFN3P60673 137 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TSPAN5P62079 268 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CCL7P80098 99 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TEX30Q5JUR7 227 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ANXA8L1Q5VT79 327 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 C5orf46Q6UWT4 87 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 NKAIN4Q8IVV8 208 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 MORN4Q8NDC4 146 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 GPR26Q8NDV2 337 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 GPR32P1Q8NGA4 272 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 OR11G2Q8NGC1 345 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TEX47Q8TBZ9 253 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 GLYATL2Q8WU03 294 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 THEM6Q8WUY1 208 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 MAL2Q969L2 176 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM203Q969S6 136 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 STARD4Q96DR4 205 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF251Q9BRH9 671 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 MED10Q9BTT4 135 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 RETNQ9HD89 108 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 RASL12Q9NYN1 266 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TAS2R5Q9NYW4 299 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 DUX4Q9UBX2 424 aa2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM218A2RU14 115 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 RAB19A4D1S5 217 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 COLCA2A8K830 154 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 H0YIV9 168 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 MKRN2OSH3BPM6 223 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 L7N2F9 121 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SULT1C2O00338 296 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 FGF16O43320 207 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SNAI2O43623 268 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 MED6O75586 246 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ATG12O94817 140 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 OR2F2O95006 317 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CD160O95971 181 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 IFNGP01579 166 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 RLN2P04090 185 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 S100A8P05109 93 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 FABP1P07148 127 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 FBP1P09467 338 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 PIRTP0C851 137 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 MPC1LP0DKB6 136 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 OR5H8P0DN80 308 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 CD79AP11912 226 aa2.74□□□□□ -1.97
POLR1B-215ENST00000498054 ADCYAP1P18509 176 aa2.74□□□□□ -1.97
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