RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	RNF150	Q9ULK6	438 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GU03	582 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GW55	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM178B	H3BS89	294 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	SIGLEC5	O15389	551 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	CGB3	P0DN86	165 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	CGB7	P0DN87	165 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	EDDM3B	P56851	147 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF585B	Q52M93	769 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR146	Q96CH1	333 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	C5orf30	Q96GV9	206 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	TIMD4	Q96H15	378 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	CCL13	Q99616	98 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	CALY	Q9NYX4	217 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4	Q9UBX2	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	YPEL1	O60688	119 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	LY6G6D	O95868	133 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV1-39	P01597	117 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	GYPA	P02724	150 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV1D-39	P04432	117 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	SELL	P14151	372 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	MMP9	P14780	707 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	FOSL1	P15407	271 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	ID3	Q02535	119 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	CATR1	Q13166	79 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB1C	Q92928	201 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	YPEL2	Q96QA6	119 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	FBXL17	Q9UF56	701 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
TMEM18-208	ENST00000497508	PITX3	O75364	302 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	CXorf58	Q96LI9	332 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	GNG12	Q9UBI6	72 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	PSG11	Q9UQ72	335 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A0G2JRQ6	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	ITGB1BP1	O14713	200 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV2-70	P01814	119 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	MORN2	Q502X0	79 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	CORO2A	Q92828	525 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	PPIAL4D	F5H284	164 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	ST8SIA5	O15466	376 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV1-5	P01602	117 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	LPAR6	P43657	344 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	LOXL3	P58215	753 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	LMO4	P61968	165 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	LTC4S	Q16873	150 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	CLN8	Q9UBY8	286 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	NF1	P21359	2839 aa		12	□□□□□ -0.49
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49

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