RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV3-13	P01766	116 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	RAB5A	P20339	215 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF726P1	Q15940	193 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	RAB39B	Q96DA2	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	LINC00473	A8K010	186 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	UBE2C	O00762	179 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	GZMH	P20718	246 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522		Q6ZS92	163 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	SNX22	Q96L94	193 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	CLN8	Q9UBY8	286 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	MGST3	O14880	152 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	OR2C1	O95371	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	CRYAA	P02489	173 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	AGA	P20933	346 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	DTD1	Q8TEA8	209 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	MUCL1	Q96DR8	90 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	OR2V2	Q96R30	315 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522		A0A1W2PR64	198 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522		A0A1W2PRV1	198 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	BCL2	P10415	239 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	MAS1L	P35410	378 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	GLRX	P35754	106 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	GPR12	P47775	334 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	TVP23C	Q96ET8	276 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522	JPT1	Q9UK76	154 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CALD1-222	ENST00000495522		A0A087WWC5	75 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	DLL1	O00548	723 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	RTP5	Q14D33	572 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	LTC4S	Q16873	150 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	SSX7	Q7RTT5	188 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	RPRML	Q8N4K4	120 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	MALSU1	Q96EH3	234 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	GNG12	Q9UBI6	72 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	USF3	Q68DE3	2245 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	CACNA1D	Q01668	2161 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	MARCH11	A6NNE9	402 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	TM4SF5	O14894	197 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	ZG16	O60844	167 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	TIMP3	P35625	211 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	RAB4B	P61018	213 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	DLK1	P80370	383 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	CR1L	Q2VPA4	569 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	LINC00205	P59089	165 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	NHLH1	Q02575	133 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	MORN2	Q502X0	79 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	YPEL4	Q96NS1	127 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CALD1-222	ENST00000495522	YPEL1	O60688	119 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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