RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494893.5

SNX17-209, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 2

Gene SNX17, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-209	ENST00000494893	CITED1	Q99966	193 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNX17-209	ENST00000494893	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNX17-209	ENST00000494893	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNX17-209	ENST00000494893	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNX17-209	ENST00000494893	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNX17-209	ENST00000494893	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SNX17-209	ENST00000494893	HAX1	O00165	279 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	RGS11	O94810	467 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893		Q8N6K4	173 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	PRRT1	Q99946	306 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	PROP1	O75360	226 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	DIRAS3	O95661	229 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	SPN	P16150	400 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CEACAM6	P40199	344 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CCR6	P51684	374 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TSPAN5	P62079	268 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	HNF4G	Q14541	408 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TMEM11	P17152	192 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	ZBTB25	P24278	435 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CD1B	P29016	333 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	BET1	O15155	118 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TXNL1	O43396	289 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TCRB	P04435	133 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	FCGR2C	P31995	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	HES1	Q14469	280 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TERB2	Q8NHR7	220 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	HSPA12A	O43301	675 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	NDUFB6	O95139	128 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	TUSC2	O75896	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-209	ENST00000494893	RITA1	Q96K30	269 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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