RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		J3KRW8	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFS8	O00217	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPY	P01298	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBP	P20226	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GZMH	P20718	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAX6	P26367	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEACAM6	P40199	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR3A3	P47888	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R46	P59540	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARF6	P62330	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTD2	P86397	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAX8	Q06710	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087X0M5	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GX30	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	YPEL1	O60688	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTTG1	O95997	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A16	P16260	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB25	P24278	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DSCR9	P59020	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXYD4	P59646	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARPC4	P59998	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNB2	P62879	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHODH	Q02127	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEF2D	Q14814	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALM	Q96C23	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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